隋文帝營造仁壽宮時，崔善爲帶領工匠五百人。右僕射楊素是工程總監，巡視到崔善爲的住地，要來花名冊點名。崔善爲手拿名冊背誦人名，五百人竟沒有一個差錯，楊素大爲吃驚。從此各地有疑難案件，常派崔善爲去審理，都能巧妙地解決。隋文帝仁壽年間，崔善爲任樓煩郡司戶書佐。唐高祖李淵當時任太守，對他十分禮遇。崔善爲看到隋朝腐敗，私下勸李淵取而代之，很受讚許。李淵起事後，崔善爲任大將軍府司戶參軍，封清河縣公爵位。唐高祖武德年間（公元618－626年），歷任內史舍人、尚書左丞，名聲很好。下級官吏厭惡他嚴厲廉明，因爲他背駝身矮，就編了順口溜嘲罵他：「崔先生彎得象只鉤，熬年頭得到封侯，肩膀上沒有脖頸，胸前多長一個頭」。高祖李淵聽到後安慰說：「淺薄的小人，仇恨正直。從前北齊末年奸吏編歌罵斛律明月，而高緯昏庸，殺了他一家。我雖然不算高明，但也絕不會幹這樣的事。」於是懸賞追查懲處編造流言的人。當時傅仁均發表了《戊寅元歷》，一時間議論紛紛，有褒有貶。李淳風也指出其中十八條錯誤缺點。奉高祖命令，崔善爲考校了傅、李二家的優缺點，有許多議論。唐太宗貞觀初年，崔善爲任陝州刺史。當時朝廷議論，讓人口稠密地區的人民遷移到人口稀少地區。崔善爲上表說：「 京城附近人口稠密，青壯年男子都編入軍府。若讓他們隨意遷移流出關外，則京城附近空虛，實在不是好辦法。」於是移民的事情沒有進行。崔善爲後來歷任大理寺卿、司農卿，工作稱職。但由於與少卿關係不好，離京任秦州刺史，死在任上。