科場失志，隨父授徒

　　陳邦彥自小聰明勤學，1621年（天啓元年），考取秀才，之後屢次參加鄉試均落榜，於是隨父在大良設館授徒，人稱巖野先生。他精研《周易》、《毛詩》和經世致用之學，在治學授徒之餘，密切關注國家大事，對府、縣的大事，均能提出適當的建議。地方政府官員遇有政事難事，常常徵詢他的意見。邦彥滿腹經綸，卻在科場上並不得志，多次應考均未能中舉。人們深爲之不平，而他卻不以爲意。

　　二次獻策，均被拒絕

　　1644年（崇禎十七年），清兵入關，定鼎中原。福王朱由崧在南京建立弘光小朝廷。國難當頭，陳邦彥五內俱焚，疾呼：「此時不思報國者，非丈夫也！」隨即結束講學，針對時局，精心撰寫了數萬言的《中興政要》，具體開列了32條抗敵救國方略，躊躇滿志地隻身赴南京進呈弘光帝，但未被接納。

　　1645年（弘光元年），南京政權被清軍攻滅，南明唐王在福州建立南明隆武朝，並於翌年委任陳邦彥爲兵部職方司，統領廣西狼兵萬餘人前往江西南安協同大學士蘇觀生抗擊清兵。他受命後曾多次提出進擊清軍的良策，但因均被蘇拒絕而坐失戰機。而在隆武帝被清軍俘獲後，陳被迫率部隨同蘇觀生撤回廣東。陳邦彥在時局危急之際，一再呼籲南明的兩個分立的政權（設在廣州的紹武政權與設在肇慶的永曆政權）化幹戈爲玉帛攜手對抗清兵。但因遭蘇觀生等的幹擾，南明分設的兩個朝廷互爲爭鬥以致相殘愈烈，因而被清兵乘隙攻擊，紹武政權與永曆政權相繼覆滅。 1645年（弘光元年）秋初，邦彥告別家人北上時，寫下了意氣豪邁、筆墨酣暢飛動的賦別之作《舟發珠江承諸子攜酒餞送次韻賦別》：揚塵伐鼓發江幹，變徵聲高七月寒。夜渡可能知大漠？日邊何處是長安！杯因惜別兼賢聖，策爲憂時雜管韓。燕石自慚仍躍冶，歸來休笑舊儒冠。

　　歸附聿鍵，抗擊清兵

　　1645年（弘光元年），弘光朝覆亡後，朱元璋的九世孫唐王朱聿鍵被一批文臣武將擁戴在福州稱帝，建立隆武朝，並訪求賢能，組織抗戰。讀了陳邦彥的《中興政要》之後，隆武帝備加讚賞，稱陳邦彥爲「奇才」，並下旨請陳邦彥速速赴閩，共商國是。因一身不能事二主的緣故，陳邦彥當時並沒有馬上到福州去。只是到了第二年的五月，南明政權被清兵摧毀之後。他才下了歸附聿鍵的決心，並且參加了六月舉行的隆武朝唯一的一次鄉試，得中第七名舉人。發榜前三天，他被聿鍵任命爲監紀推官。

　　1646年（隆武二年），陳邦彥升兵部職方司主事，監粵兵入江西，協助蘇觀生防守北線。清兵壓境，猛攻贛州，蘇觀生按兵不動，逡巡觀望，陳邦彥雖一再請戰而未獲批準。贛州失守後，清軍大舉入閩，攻下福州。隆武朝的武將鄭芝龍公開投敵，隆武帝被俘遇害，隆武朝也步了弘光朝的後塵。此時，蘇觀生急於回廣州擁立新主，置邦彥的憑藉五嶺和韓江天險，抵擋北、東兩面來敵，以保住廣東，建立鞏固的根據地的建議於不顧，下令全軍撤防。邦彥要蘇觀生火速率主力取道惠州和潮州，救援尚在苦撐的泉（州）、漳（州）前線守軍，並請求自領一軍扼守南安，抵抗北路清軍的請求也未被採納，只好一同南撤。

　　重組部隊，妙計救主

　　1646年（隆武二年），陳邦彥化名潛入高明縣山區重組反清武裝，並會同義軍餘龍部進擊廣州、順德兩地。清將李成棟攻陷肇慶，深入廣西腹地追趕永曆君臣。不久，佟養甲、李成棟部清軍偷襲廣州，紹武政權覆亡。在廣東肇慶的永曆帝聞風而逃到了廣西。李成棟軍乘勝追入廣西，永曆朝廷岌岌可危。

　　陳邦彥救主心切，跑到順德請餘龍幫忙。餘龍等人本是當年明將萬元吉在廣東招募的援贛部隊，贛州失陷之後，生活無着，便在甘竹灘落草爲寇，原隊人馬加上歸附的潰兵也有二萬多人。經說服，他們同意協助陳邦彥攻打廣州。另一方面，陳邦彥又聯絡上了東莞的抗清義士張家玉，張也同意助他一臂之力。

　　眼看着大兵壓境，佟養甲忽生妙計，他下令關閉城門，不準出戰， 一邊派出快馬到廣西急召李成棟回師。一邊四出散播謠言說，李成棟的大軍已經在回穗途中了，很快就要殺到甘竹灘去了。餘龍是個大老粗，不知就裏，急着要保衛他的老巢，也不知會陳邦彥，顧自撤圍先走；剩下陳邦彥孤掌難鳴，也只好黯然收隊。後來知道，李成棟接到廣州的告急文書後，確實是很快就放棄了對桂林的包圍，轉而回援廣州。永曆君臣這回能脫離虎口，得歸功於陳邦彥圍魏救趙法的妙用。

　　之後，陳邦彥派門生馬應房與之合兵收復順德。接着他又相繼串連東莞張家玉，南海陳子壯，順德胡靖、梁斌，新興梁信灼，新會黃公輔、何世熊，恩平王興，陽江莫廷蘭，東安（今雲浮）何仕璋舉義，合力牽制清軍。李成棟被迫放棄追擊永曆帝，回師東下。邦彥得報，派馬應房等率水軍到順德黃連鄉北攔江截擊，奈何寡不敵衆，敗於敵手。邦彥又趁李成棟進攻張家玉部之機，會同高明麥而炫、歐懷昊一舉攻下江門。

　　妻兒被殺，戰事失利

　　1647年（永曆元年）初，視邦彥爲心腹大患的巡撫佟養甲，用卑劣手段突襲順德，抓走了在龍山避難的陳邦彥的兩個兒子和尹、虞尹和一個姓何的妾，把他們作爲人質，招降陳邦彥。邦彥在招降書上凜然批覆：「妾辱之，子殺之，皆唯命。身爲忠臣，義不顧妻子也。」這一妾二子，後來都被清軍殺害。

　　1647年（永曆元年）七月，陳邦彥在廣州物色到被迫降清的楊可觀、楊景燁、黃天錫等三位前明軍官，讓他們在城中做內應；又佈置三千「花山盜」向清軍詐降，混跡於清軍之中，伺機起事。他和前明禮部尚書陳子壯（南海人）則計劃好兵分兩路，同時進攻廣州。陳子壯兵出九江，負責攻打西南方，陳邦彥統率水軍，集中突擊西北。三方面約定七月七日爲舉事之日。然而由於某些尚不清楚的原因，事情的進展不能如意。陳子壯的部隊提早了兩天到達廣州，駐紮在五羊驛。他的一名家僮被清軍俘虜，供出實情（一說有叛僧告密），結果城內三千「花山盜」和楊可觀等三人均被清軍查獲處死。

　　形勢對二陳十分不利。這時李成棟在東莞擊敗張家玉，回城途中，船隊駛到禺珠洲，與陳邦彥水軍碰個正着，雙方於是展開了一場血戰。陳軍藉着風勢發動火攻，李成棟抵敵不住，往後敗走，陳軍在後緊追不捨。當時，陳子壯的部隊正埋伏在白鵝潭附近，準備隨時接應陳邦彥。邦彥軍船上插朱飾青旗，他們原來是知道的，但由於時值黃昏，暮色蒼茫，士兵們竟然不能分辨旗色，望見前面黑壓壓一片戰船，乘風破浪而來，以爲大隊清兵殺到，心下不免着慌，及至看清楚在敵人的背後還有自己人時，大亂陣腳，終大敗虧輸。

　　之後，陳邦彥糾合敗卒轉攻三水，又轉攻高明，繼而與清兵接仗於新會和香山，後來得到故明清遠指揮白常燦接應，遁人清遠，在江口設木柵頑抗。清兵追到，再次施以火攻，陳軍連戰失利，部將霍師連連陣亡，不得已而退入城中固守。

　　清兵圍城，寧死不屈

　　清軍包圍清遠城，猛攻十日不下。戰鬥從早晨打到下午，陳邦彥身上多處受傷，次子馨尹死難，他本人亦肩中三刀，鮮血淋漓。心知大勢已去，便退走到朱氏園，在園壁上題了三首詩，其中一首六言詩寫道：

　　「平生報國懷深，日望西方好音。已共萇弘化碧，還同屈子俱沉」。

　　另一首雲：

　　「無拳無勇，無餉無兵。聯絡山海，矢助中興。天命不佑，禍患是嬰。千秋而下，鑑此孤貞！」

　　寫畢，一頭扎進池水中以圖一死報國，誰料卻被追兵拉起，他仰天大笑：「我就是陳兵科陳邦彥！」陳邦彥被押到廣州後，佟養甲派醫生爲他治傷，送上佳餚想勸降，可是邦彥拒絕了，他以文天祥爲榜樣，寫了《獄中步文丞相韻》詩，謂「泉路若逢文相國，不知雙眼可誰青？」在獄中絕食五日。1647年（永曆元年）9月28日，佟養甲眼見勸降無望，於是下令將邦彥押往四牌樓（故址在今解放南路）殺害。

　　臨刑時，邦彥慷慨寫下《獄中五日不食臨命歌》：「天造兮多艱，臣之江也滸。書生漫談兵，時哉不我與。我後兮何之？我躬兮獨苦。崖山多忠魂，先後照千古！」歌罷，從容就義。死後，永曆帝贈邦彥兵部尚書，諡忠愍，廕子錦衣指揮（見《明史》）。後人慕其忠烈，將他與陳子壯、張家玉尊稱爲「嶺南三忠」，並以他爲首。